Tudo o que você precisa fazer é remover a linha theme_frame
do arquivo de manifesto do tema do Chrome.
Aqui é um breve tutorial do YouTube sobre como fazer isso.
No entanto, depois de ter seguido os passos dessa página, é necessário recarregar o tema. Foi isso que me confundiu anteriormente. Para recarregar o tema (no Google Chrome), vá para Configurações »Extensões» Carregar tema descompactado.
Isso abrirá uma caixa de diálogo. Nessa caixa, selecione a pasta na qual o arquivo de manifesto está diretamente.
Agora, o seu tema do Chrome deve corresponder ao seu tema do Windows!