Havia duas versões principais dos protocolos SSH: Versão 1 e Versão 2. Geralmente, as versões posteriores do software suportam ambas as versões do protocolo (embora eu acredite que seja uma prática recomendada desativar o suporte da versão 1 do SSH no SSH configuração do daemon / sevice).
A versão atual do programa ssh-keygen do OpenSSH geralmente gera chaves (para o protocolo SSH 1 ou 2) em uma pasta chamada .ssh
Alguns programas comerciais SSH e aparentemente algumas versões anteriores do openssh pode usar uma pasta .ssh2.