Acabei de testar isso e parece funcionar como esperado: O arquivo está na "versão anterior" da pasta.
Por favor, note que eu usei "ponto de restauração" e não backup, mas a "mágica" é basicamente a mesma de qualquer maneira.
Digamos que eu configure o Backup do Windows para fazer backup de minhas fotos. Sei que, no futuro, posso ver a guia "Versões anteriores" para restaurar um determinado arquivo de volta a uma cópia antiga.
Mas , suponha que eu tenha várias versões anteriores de um arquivo no meu computador e mova esse arquivo para uma nova subpasta (que é ainda no Backup do Windows). Ainda terei acesso a versões anteriores do arquivo quando ele estava na pasta antiga por meio de "Propriedades"?