AFAIK não pode ser feito facilmente. você pode configurá-lo para um programa e usar o Gmail, ou usar um reghack como este link
O IE pode ter addons para fazer isso também, mas seus addons são poucos e ruins.
Alguém sabe como adicionar ou alterar o cliente de email padrão no Internet Explorer 8/9? Gostaria de ter links de mailto abertos com o Gmail, da mesma forma que o Firefox é capaz.
No Firefox, acesse o Gmail e, na barra do seu navegador, digite:
javascript: window.navigator.registerProtocolHandler ("mailto", "https: // mail.google.com/mail/?extsrc=mailto&url=%s","Gmail ")
Isso tornará o Gmail o padrão no Firefox.