Você pode desativar a aceleração do mouse dessa maneira.
Crie um arquivo /usr/share/X11/xorg.conf.d/50-disable-mouse-accel.conf
com este conteúdo
Section "InputClass"
Identifier "My Mouse"
MatchIsPointer "yes"
Option "AccelerationProfile" "-1"
Option "AccelerationScheme" "none"
Option "AccelSpeed" "-1"
EndSection
e reinicie a sessão.