Eu tenho exatamente o mesmo problema e depois de muita pesquisa tudo o que eu pude fazer para parar a renumeração automática estúpida foi desligar a numeração e inserir manualmente os números em cada lista.
Estou escrevendo um manual de procedimentos e configurei um template com seções contendo cabeçalhos padrão e listas numeradas e cada vez que colei o template no meu documento os números seriam automaticamente renumerados - algumas vezes continuando da seção acima, às vezes aleatoriamente para outros valores. Muito frustrante.
Faz mais sentido que nunca continue a numeração a partir da lista anterior, se a função copiar / colar for invocada.
Seria ótimo ter a opção de desativar esse recurso irritante em algum lugar no MS Word.
Estou usando o MS Word 2010 e assumo que ele se comporta da mesma maneira no MS Word 2013.