Infelizmente, se os marcadores foram sobrescritos, não há como restaurá-los. Você pode tentar usar um navegador SQLite como o link para abrir o arquivo de Favoritos e tentar salvar o máximo de informações possível.
Se você usar a funcionalidade de sincronização do Chrome, deixe a sessão do navegador atual aberta, vá para outro computador e faça login na sua conta de sincronização do Google Chrome para acessar e exportar seus favoritos. Você pode ver se os seus favoritos ainda estão armazenados pelo Google procurando pelo link
Boa sorte!