Now if I encrypt my system partition, in sleep mode, some RAM contents can be placed on that separate partition. I guess this will be unencrypted.
Mesmo se isso for verdade, a única maneira de acessar as informações é fazer login na conta do usuário, o que exigiria uma senha para a conta.
Also, I've noticed that I have the option to encrypt only the Windows system partition or the entire disk. How could TrueCrypt encryption affect the Rapid Start partition, does it even work at all? (When going to sleep, the Intel driver maybe could use encryption to store the data, but when resuming, can the data be decrypted?)
Se você for usar criptografia em um SSD, deverá criptografar o dispositivo INTEIRO. O firmware movimenta continuamente os dados, se você colocar dados no SSD não criptografados, que os dados, mesmo quando forem excluídos, ainda poderão ser acessados até que sejam eventualmente substituídos.