Provavelmente é o Gmail - ele foi desenvolvido para fazer isso, afinal, e procura por vírus. Eu suspeito que o uso de um método de compactação menos comum possa funcionar (o .xz pode funcionar para um único arquivo - os arquivos zip são verificados em meus testes não científicos do Gmail) ou simplesmente gravá-los em um DVD ou outra mídia. .
Considerando que você está respondendo a incidentes, seria pedir demais para acessar o site diretamente para fazer o download dos arquivos? Isso seria o mais simples e você poderá observar o comprometimento em seu ambiente nativo.