Quando você cria um hardlink, você está criando duas entradas separadas do sistema de arquivos apontando para os mesmos dados físicos no disco.
Quando você faz um dir, ele exibe o tamanho dos dados que estão sendo armazenados no local em que a entrada do sistema de arquivos está apontando.
Portanto, se você criar 100 links para um único arquivo, todos eles informarão o mesmo tamanho - eles estão relatando o tamanho dos dados armazenados. Isso não significa que os hardlinks ocupem esse espaço - na verdade, não. Um link físico ocupa muito pouco espaço.