Sua pergunta não é muito clara porque você não informou como o desinstalador falhou. Com as informações que você forneceu, acho que a solução mais universal é reinstalar a mesma versão do NetBeans no mesmo diretório, com opções de instalação idênticas. Isso deve resolver problemas com sua instalação atual e deixar você com o Netbeans em funcionamento (se você quiser continuar usando-o) e o desinstalador de trabalho (se quiser se livrar dele).