Não há necessidade de desfragmentar se você for fazer uma instalação limpa, pois tudo será limpo de qualquer maneira. Mas, como sugerido pelo cartaz anteriormente, defrag depois de instalar o Windows + todas as atualizações + todos os seus programas; a unidade pode ficar um pouco bagunçada depois de toda a criação / modificação / exclusão de arquivos dessas ações.
O utilitário de desfragmentação do Windows leva muito tempo para ser desfragmentado, portanto, um utilitário de desfragmentação automática de terceiros rápido seria uma boa escolha. Você pode ativar a desfragmentação automática e deixar que ela funcione em segundo plano.
E execute a limpeza de disco após todas as instalações e antes da desfragmentação. Não há sentido em desfragmentar arquivos temporários.