Se você não consegue ver usando o Nautilus, pode tentar usar o Terminal.
Abra o terminal e digite cd / Agora você está na pasta /. Se desejar, digite ls para listar todas as pastas e arquivos nessa pasta. Agora, você pode digitar cd opt para inserir a pasta opt. Novamente, digite ls para ver as pastas e arquivos lá.
Talvez não o ajude, mas é tudo em que consigo pensar ... A menos, claro, se você tentou instalar um gerenciador de arquivos diferente.
Você pode experimentar os seguintes: Nemo, Thunar e Dolphin, que são os que eu conheço, mas apenas pelo nome, nunca usei. Basta procurá-los no Ubuntu Software Center!