Acho que o repasse funcionará para você se inserido com antecedência suficiente. Descobri no Google Docs que, se eu inserir manualmente o passeh, ainda não posso digitar, mas se eu recarregar a página com o pass-through ativado, as coisas funcionam.
Você pode aproveitar o recurso :autocmd
do pentadactyl para executar o comando pass-through automaticamente com base em um regex de URL. Por exemplo, para desativar pentadáctil no Google Docs, você digitaria o comando
:autocmd LocationChange 'https://docs.google.com/*' :normal! <C-z>
Você pode tornar essas alterações permanentes salvando esses comandos no arquivo .pentadactylrc
.