Eu usaria um CD ao vivo do GParted. O GParted é gratuito e funciona.
Aqui está um link para um tutorial sobre o uso de gparted live cd em partições do Windows .
Eu usei esse mesmo método no computador da minha esposa recentemente para realizar quase a mesma coisa.
Se tudo que você tem na partição e: são arquivos que você não deveria ter que reparar o sistema quando você reinicia. Se tudo correr bem, deve ser uma solução rápida.