Pode ser que o cache ou o buffer do HDD não seja tão grande e / ou que as unidades precisem ser desfragmentadas.
Eu recomendo dividir os arquivos que você está tentando copiar, usando Winrar ou HJSplit .
Eu também fecho todos os outros programas que leem / gravam muitos dados, ex. software de compressão, software de edição de vídeo ...
Você também pode tentar usar um software chamado TeraCopy . É mais rápido e pode fazer uma pausa (no caso de você precisar usar o computador sem atraso nesse meio tempo.