A resposta é normalmente não. Geralmente, é algum tipo de erro do usuário, e eles nem percebem que fizeram isso.
Eu verificaria meus backups (veja a lista de arquivos que uma restauração oferece), e compare-os com o conteúdo da pasta atual, que lhe dirá com certeza se o usuário está enganado, o que eu tenho visto 100% de A Hora. Na minha experiência, eles sempre levaram acidentalmente uma pasta para outra pasta. Se eles puderem lhe dizer o nome de um arquivo específico, um simples dir PartialFileName*.* /s
encontrará onde ele foi movido acidentalmente.
Outra opção: não sei se você tem as Cópias de Sombra ativadas, mas, se estiver, clique com o botão direito do mouse no compartilhamento e depois na guia "Versões Anteriores". Você pode encontrar algo lá também, mas não tenho certeza se mover o arquivo também move a sombra.