Para mim, como um clássico universidade / escola / local de trabalho bloqueando portas ou filtrando tráfego, minha primeira sugestão seria não tentar ignorar seus firewalls, por experiência existe por uma razão e eles não parecem gentis com as pessoas recebendo em torno dele.
Próximo; mudar o roteamento em seu computador dependerá completamente do sistema operacional que você está usando, então qual sistema operacional você está executando no cliente?
Para que funcione, você provavelmente precisará criar algum tipo de conexão VPN para que o tráfego bloqueado seja encapsulado através do filtro em vez de ser descartado. Basicamente, isso significa instalar um cliente VPN na estação de trabalho em sua universidade e, em seguida, instalar um servidor VPN em algum lugar da Internet (fora de sua universidade).
Alternativamente, você pode comprar um serviço VPN, caso em que você não precisaria fornecer o servidor VPN da Internet, o que pouparia algum dinheiro se você ainda não tivesse o servidor público.
Por fim, a maioria dos serviços VPN funcionará como uma rota padrão para seu tráfego, o que significa que qualquer tráfego com acesso à Internet passará por esse túnel criptografado. Você simplesmente precisa adicionar seu próprio roteamento no sistema operacional que usará apenas o túnel para o seu tráfego de aplicativos e todos os outros tráfegos serão roteados normalmente.
Como dito antes, isso depende completamente do sistema operacional usado por você.