O Ubuntu 11.10 traz o kernel 3.0 (incluindo suas atualizações, claro).
Você poderia experimentar uma versão beta do Fedora 16, que traz o kernel 3.1 (mas note que 3.1 ainda não foi oficialmente lançado).
Observe também que 2.6.39 foi a versão anterior a 3.0 e não se deixe enganar pela diferença de versão principal: Linux 3.0 == Linux 2.6.40