Por vários bons motivos, não há ferramentas para o Linux que correspondam à funcionalidade do SSMS. Se você precisar de algo assim, execute uma pequena VM do Windows em sua máquina Linux e use o verdadeiro negócio.
Além do SQuirrel Universal SQL Client, você também pode experimentar o aplicativo gratuito da Oracle:
Oracle SQL Developer link
Como o SQuirrel, ele é escrito e Java e depende do driver jTDS JDBC. O que provavelmente significa que tem o mesmo conjunto de limitações. O mesmo vale para as ferramentas que estão se conectando através do ODBC-SSMS conecta-se diretamente ao SQL Server e pode fazer muitas coisas que uma ferramenta JDBC / ODBC genérica simplesmente não fará.