Um NTFS de 50 MB recém-criado levará cerca de 35 MB para suas estruturas internas . Isso é algo que você perde antes de colocar QUALQUER arquivo nele.
O NTFS simplesmente não é adequado para unidades pequenas. Eu recomendo que você formate o drive com o FAT. Ele tem muito menos sobrecarga e não há nenhum benefício real em uma unidade tão pequena do NTFS de qualquer forma.
Claro, se você precisa de segurança NTFS, a única solução é fazer um disco maior.
P.S. Veja como as coisas ficam na unidade NTFS EMPTY de 50 MB:
48127 KB total disk space.
5184 KB in 6 files.
12 KB in 13 indexes.
0 KB in bad sectors.
2723 KB in use by the system.
2048 KB occupied by the log file.
40208 KB available on disk.
na unidade FAT de 50 MB, não há quase nenhuma sobrecarga e você terá 47920 KB disponíveis.