Não, até onde eu vejo, não existe essa opção (embora possa ser útil).
Se houvesse essa opção, seria no Configurações de impressão ("Configurações " / "Impressão"). Há opções para imprimir números de linha, alterar as cores e adicionar cabeçalhos / rodapés. No entanto, não há nada para controlar a impressão de sublinhados de erros ortográficos.
A única solução que consigo ver é desabilitar a verificação ortográfica antes da impressão, como você observou. Existe um atalho de teclado para alternar isto, Alt + A . Se você pressionar antes de imprimir (e depois, para reativar), você resolve o problema com dois toques no teclado.
Se você achar que esse recurso também pode ser útil para outras pessoas, considere escrever um tíquete para solicitá-lo. Problemas do NotePad ++ são rastreados no GitHub, projeto notepad-plus-plus / notepad-plus-plus ; considere postar um problema lá.