Na maioria dos sistemas, incluindo o Linux, a menos que o relógio esteja muito desligado, o ntpd não ajusta o relógio; em vez disso, ele varia o comprimento de um segundo, para que o relógio lentamente se sincronize com o mestre.
Isso está chamando a distorção do relógio, e é benéfico porque normalmente é melhor que um segundo seja um pouco errado do que em segundos, ou, pior ainda, refeito.