Pode ser o que você está procurando?
Na verdade, ele não move itens para a bandeja, mas os "oculta" na barra de tarefas ....
Bom para o processo cygwin X11 que você realmente não quer na sua barra de tarefas,
mas também não precisa na bandeja do sistema.
Outras opções (mas não experimentadas) podem ser:
- Minimizador de Bandeja de 4t
- PowerMenu (mencionado acima com boa captura de tela)
- WinRoll
- RBTray
- TrayEverything
- TrayIt
- Trayconizer
- TaskSwitchXP
Eu não tenho os links, mas o google deve ajudar. Talvez isso deva ser um post de wiki da comunidade? (uma vez eu já descobri o que isso significa)