Você pode controlar se o arquivo está definido como esparso ou não executando (a partir de um prompt de comando elevado) fsutil sparse setflag <filename> 0|1
Para desativar a configuração esparsa, execute:
fsutil sparse setflag YOURFILENAMEHERE 0
Para ligá-lo novamente, execute:
fsutil sparse setflag YOURFILENAMEHERE 1
e para consultá-lo:
fsutil sparse queryflag YOURFILENAMEHERE
Achei isso por tentativa e erro e uma pesquisa em TechNet - Eu não saio definindo ou desarmando arquivos esparsos, então não posso falar sobre nenhum risco de fazer isso, além do (s) arquivo (s) ocuparão muito mais espaço real do que eles poderiam ter de outra forma.