O SATA deve ser compatível com versões anteriores e posteriores, portanto, qualquer coisa que realmente atenda à especificação deve funcionar em qualquer outra coisa. Você pode usar unidades SATA2 em interfaces SATA3 e pode usar unidades SATA3 em interfaces SATA2. Isso não é diferente de quando o SATA2 foi lançado pela primeira vez com interfaces SATA, exceto pelo fato de que mais dispositivos atendem às especificações corretamente, então você não precisa configurar jumpers ou algo assim - deve Just Work ™. (Note, claro, que você sempre correrá na velocidade do link mais lento da cadeia).