Versão resumida: Abra trash:// no Nautilus. Você não precisa saber onde está localizado fisicamente; é só usar "Empty Trash".
Versão mais longa:
-
Se o arquivo estava no mesmo sistema de arquivos do diretório inicial (raiz):
~/.local/share/Trash/ -
Se estiver em um sistema de arquivos separado, e
<rootdir>/.Trash/existir e estiver no modo 01777:
<rootdir>/.Trash/<uid>/ -
Se estava em um sistema de arquivos separado, mas
<rootdir>/.Trash/não existe ou tem permissões erradas:
<rootdir>/.Trash-<uid>/
Aqui, < rootdir > é o diretório raiz desse sistema de arquivos. Nesse caso, é / , então simplesmente /.Trash e /.Trash-<uid>/ .
< uid > é o ID do usuário - nesse caso, 0 para raiz.
O diretório que você está procurando é /root/.local/share/Trash/ .