Você pode ocultar a letra da unidade no meu computador. Isso impediria que as pessoas o vissem. Isso pode ser o suficiente. Este guia mostra como fazer no Vista / Windows 7
Caso contrário, você também poderá definir permissões na unidade para serem apenas do sistema (se essa for a conta que o backup do Windows usa). Você pode se apropriar dos arquivos novamente como administrador quando precisar.