Até onde eu sei, não com os comandos internos do Windows.
Pegue o Console de Comandos LE , um interpretador de comandos compatível com cmd.exe pode salvar variáveis como variáveis do sistema e do usuário. Verifique o comando SET com os parâmetros / S e / U, respectivamente.
set /s sysvariable=whatever
set /u uservariable=whatever
Eu não usei isso, mas o editor de ambiente rápido parece bom e é gratuito.