Eu nunca fiz o backup do Chrome antes e estou sempre alternando entre vários sistemas operacionais. Fazer o login com minha conta do Google retira todos os favoritos, senhas e histórico sem ter que transferir / restaurar manualmente o perfil.
O% LocalAppData% muda muito, porque todas as atualizações estão instaladas aqui, pois não requer direitos de administrador e permite que a atualização ocorra sem qualquer intervenção do usuário. A empresa para a qual trabalho também implementa a mesma tática para nosso aplicativo.
Portanto, para resumir, não é necessário fazer backup do perfil. Você pode 100% confiar na sincronização do Chrome: -)