É difícil trabalhar com as fotos, mas eu diria que L1 e C6 estão formando um filtro LC no suprimento para a porta USB. O valor relativamente grande de C6 provavelmente também serve como uma tampa de reservatório para ajudar a lidar com a queda de tensão causada por picos de corrente curtos sobre o cabo razoavelmente fino. Você pode descartar problemas com esses componentes medindo que você tem 5V no conector USB com um multímetro ou conectando um dispositivo como um telefone que tentará carregar se a enumeração USB não for concluída.
D1 pode ser um diodo de grampo, eu esperaria um par deles para proteger D + / D-, mas pode ser algum tipo de grampo de fonte de alimentação. Dependendo de como você está experimentando experimental, você pode tentar removê-lo caso ele falhe em curto. Pode deixar a placa-mãe aberta para danos causados por fontes externas de sobretensão / ESD, etc.
Todos os componentes na parte inferior do PCB parecem encaminhar para o conector de áudio, por isso duvido que tenham alguma coisa a ver com isso. Em geral, olhando para o PCB, a maior parte da interface USB principal deve estar na placa-mãe, então eu diria que é provável que, se você estiver recebendo energia da porta USB, o problema seja mais provável de estar na placa-mãe. Se não, o problema ainda pode estar na placa-mãe, mas você realmente precisa rastrear as conexões e ver se está recebendo energia na VUSB sem essa placa conectada.