Como Daniel B comentou, uma das razões pelas quais os discos fisicamente grandes são um problema é a força centrífuga. Quanto maior o diamereter do disco, mais força é exercida sobre o disco à medida que ele gira. Isso terá que ser compensado por uma placa mais grossa para aumentar a durabilidade, mas isso não é um aumento linear, pois o disco também terá que suportar sua própria massa, reduzindo assim o volume total disponível no interior.
Existe também um limite de velocidade de leitura: conforme o setor se move mais rápido devido às leis da geometria e um raio crescente, a cabeça terá que se mover mais rápido para acompanhar. Não tenho certeza se esse é um verdadeiro gargalo hoje, mas é certamente algo para se ter em mente.
Por último, existe o fato de que o 5.25 é um fator de forma que não é mais comum.Para memória de estado sólido, 5,25 faz muito mais sentido, já que não há partes móveis que precisam ser dimensionadas de acordo, mas como isso teria uma aplicação muito limitada, duvido que ofereça muito retorno de investimento para os fabricantes .