AFAIK existem 3 tipos de dispositivos em uma placa-mãe que exigem -12V.
- RS232, portas RS485 sem circuito interno para gerar a tensão negativa.
Estes estão começando a se tornar muito raros ... Não encontrei nenhum nos últimos 5 anos ou mais. - (mini-) slots PCI. Eles estão sendo gradativamente eliminados em favor do PCI-e, mas ainda há muitos computadores novos que ainda os possuem.
- Algumas placas de som high-end exigem -12V como tensão de referência. Estes são geralmente alimentados a partir de um slot PCI, o que nos leva de volta ao ponto 2.
(Houve algumas placas-mãe que tinham essa placa integrada na própria placa-mãe.)
Os fabricantes de PSU não podem saber de antemão se a placa-mãe realmente precisará do -12V, então eles continuarão adicionando a linha de -12V ao plugue, desde que o padrão ATX exija isso.
E não é apenas uma questão ou se é necessário ou não: se você não incluir, sua PSU não será compatível com ATX e você não poderá vendê-la como tal.