O virtualbox-4.2 tentava substituir o virtualbox-4.1.12, mas o virtualbox-qt ainda dependia do virtualbox-4.1.12.
Remova o virtualbox e o virtualbox-qt usando
sudo dpkg -r virtualbox-qt
sudo dpkg -r virtualbox
e tente reinstalar o VirtualBox 4.2 novamente.
P.S. Use o apt-get se você puder.