Os processos em uma sessão SSH pertencem ao processo do seu shell; normalmente: sshd [your-username] tty[your-tty]
.
Quando você mata sua sessão, todos os processos filhos também são encerrados.
Para contornar isso, use multiplexação de terminal ou daemons.
Os multiplexadores mais comuns são a tela e tmux .
Você iniciaria a tela usando o screen -S my-session-name
e executando o processo normalmente.
Você pode então pressionar ctrl + a , d para desanexar da tela, e o processo ainda estará em execução, mas como filho de tela, não sua sessão ssh
Para reconectar, digite screen -x my-session-name
(-r também funciona)