Não importa o que você faça, prossiga com cautela. Você poderia piorar se você aplicar a correção errada. Idealmente, você deve fazer um backup completo de baixo nível do disco para um disco reserva; mas percebo que isso pode não ser prático com um disco de origem tão grande.
Minha primeira sugestão é estudar minha documentação do fdisk da GPT, e particularmente a página sobre < a href="http://www.rodsbooks.com/gdisk/repairing.html"> consertando discos GPT. O A página da Wikipedia no GPT também merece ser lida. Depois de entender as estruturas de dados, você estará mais bem preparado para tentar a recuperação. Em particular, você pode usar as opções em gdisk 's recovery & menu de transformação para carregar os dados de backup da GPT, bem como a função de verificação ( v em qualquer menu) para obter um diagnóstico mais preciso do que está errado com o disco. Se tiver sorte, você pode descobrir que suas partições do Windows existem na tabela de partições de backup, e você poderá restaurá-las carregando essa tabela de partições.
Se você tiver azar, as duas tabelas de partição terão sido danificadas e você precisará recorrer a uma ferramenta como TestDisk para recuperar seus dados. (Existem ferramentas semelhantes para o Windows, mas eu não estou familiarizado com elas, então não posso fornecer um link.) Há uma boa chance de que o TestDisk possa recuperar suas partições, mas não posso fazer promessas sobre isso.
Minha suspeita é que isso foi causado por um programa do Windows projetado para uso em um computador baseado em BIOS que gravava dados "brutos" no disco para a área imediatamente após a área do MBR. Esta área é oficialmente não alocada, e por isso várias ferramentas levaram a usá-la como se fosse seu playground pessoal. O uso mais comum é para carregadores de boot, como o GRUB, mas até mesmo muitas ferramentas que não são do sistema armazenam dados lá. (IIRC, o Netflix faz isso, por exemplo.) O problema é que, em um disco GPT, é onde as tabelas de partição são armazenadas, portanto, o armazenamento de dados nessa área causa danos ao disco. Se eu estiver certo sobre a causa, esse problema ocorrerá novamente, a menos que você identifique e desinstale imediatamente o software ofensivo. Você pode simplificar a recuperação criando um backup dos dados da GPT usando a opção gdisk b no menu principal. se o disco for descartado novamente, você poderá recuperar usando a opção l (que é uma letra L, não um número 1) da opção de recuperação & menu de transformação.
Boa sorte!