Use o modo Expressão Regular. Você pesquisará por um retorno de carro (o Windows usa \ r \ n como um retorno de carro), algum texto e, em seguida, outro retorno de carro. A substituição com lhe dará de volta apenas as coisas entre parênteses. Certifique-se de executar "Substituir tudo", pois não testei ao substituir um de cada vez.
Find what: (\r\n.*)\r\n Replace with: