Muitos lançamentos atrás, quando as pessoas usavam disquetes e escreviam suas próprias modelines, era bastante comum quebrar acidentalmente ou desconfigurar o X11, e ter várias páginas de manual abertas em todos os seis ttys enquanto tentava consertá-lo.
Hoje, acho que é apenas por hábito - muitos usuários estão acostumados a ter os primeiros 6 ttys disponíveis para o login de texto, porque é assim que o Linux funcionou por muitos anos. Isso também está em várias documentações e tutoriais.
No entanto, o Fedora recentemente decidiu colocar o X11 no primeiro tty (vc1).