É seguro, nada de ruim vai acontecer (a própria recuperação deve estar sendo executada em X: ). A menos que o outro disco esteja tão danificado (superfície do prato ou conjunto do cabeçote), a execução do chkdsk só irá piorá-lo. Eu acho que você precisa deliberadamente especificar o volume no disco, no entanto. Caso contrário, por que pediria para desmontar C: ? O que quero dizer é: chkdsk / R D: , se D: é a unidade que você inseriu no sistema. Pode ser verificado pelo diskpart - volume da lista .