Você pode usar unidades SATA3 na sua configuração SATA2, mas ele só será executado em 3Gbps.
Se você quiser 6Gbps, você pode comprar uma placa de expansão SATA3 de 6 Gbps.
A StarTech faz algumas , e tenho certeza que os outros também o fazem.
Veja um NewEgg search por exemplo.