Se você estiver executando uma pilha HWE antiga, não estará mais recebendo atualizações para o kernel e para a pilha Xorg e, como tal, não receberá atualizações de segurança. Dito isto, se você realmente quiser desativá-lo, faça o seguinte:
sudo touch /var/lib/update-notifier/disable-hwe-eol-messages