O MacPorts instala pacotes do Python 2.7 em /opt/local/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages . Verifique se esse caminho está em sys.path em Python. O SciPy seria instalado em scipy nesse diretório. Além disso, verifique port contents py27-scipy para garantir que os arquivos estejam no lugar certo.