Para o Windows e o Reader, você pode configurar as preferências para que as atualizações sejam instaladas automaticamente. Java ainda requer alguma ação no entanto. Há uma boa chance de que eles não estejam usando o Java, exceto raramente, então apenas desinstale-o - ele estará de volta se for necessário e enquanto isso for uma falha de segurança a menos. E como eles provavelmente cancelaram as verificações de vírus também, tudo ajuda ...
Como alternativa, você mesmo pode fazer as atualizações com o LogMeIn ou o Teamviewer.
Pessoalmente, desisti e coloquei todos no Ubuntu.