No Windows 7, %USERPROFILE%\Application Data
é apenas um link simbólico para %USERPROFILE%\AppData\Roaming
. Está lá para manter a compatibilidade com softwares mal-escritos, então, por padrão, o symlink tem uma ACL que você não pode abrir no Explorer, enquanto os programas ainda podem acessar os arquivos dentro dele.
Da mesma forma, Local Settings
agora é um link simbólico para %USERPROFILE%\AppData\Local
.