Você pode querer executar algo como SpinRite (grc.com) em seus discos rígidos para ver se eles estão no modo "quase-falha". Se você obtiver muitos eventos de nova tentativa no HD, então ele diminuirá consideravelmente também levará a mais calor do que o normal, portanto, a operação excessiva do ventilador.
Você não disse qual sistema operacional ou qual verificador de vírus. Alguns verificadores de vírus (Norton para minha situação) são muito ativos e nem sempre aparecem com precisão na tabela de processos. Se você puder fazer isso com segurança, desligue o verificador de vírus, reinicie e veja se ele melhora a capacidade de resposta.
Outro potencial silencioso é o "serviço de indexação da Microsoft". Se você não precisa, desligue-o, pois para a maioria das pessoas é apenas um PITA.
Hotei