Você pode tentar editar os arquivos XML de definição de menu em /usr/share/gimp/2.0/menus/ .
O arquivo-chave para o menu do aplicativo é image-menu.xml .
Você não conseguirá obter tudo dessa maneira - por exemplo, entradas de menu criadas por plug-ins ainda serão exibidas. Mas se você não quiser que um plug-in apareça lá, provavelmente também não o desejará em seu GIMP.
Por favor, note: alterações nestes arquivos de definição de menu afetam todos os usuários do seu sistema.