Já que a unidade está funcionando e eu presumo que as portas do laptop também funcionem, é complicado. É difícil dizer com certeza sem testes, mas meu instinto é um problema de energia. O flash drive está consumindo muita energia e o laptop está desligando a porta, ou o laptop não está fornecendo energia suficiente.
Tente usar um medidor de energia USB como este , que informará o que está acontecendo no nível de energia . Minha intuição é um problema de poder.