Eu pessoalmente nunca tive nenhum problema com isso. Eu tive um computador de mídia funcionando durante dias sem perceber que o youtube ainda estava ligado e acabei em vídeos totalmente diferentes ou em um loop.
Geralmente, desde que você tenha percorrido todo o caminho até o topo, ele deve sempre ser reproduzido automaticamente. Se você rolou até os comentários, a reprodução automática será interrompida.
Em alternativa, pode criar uma lista de reprodução com todos os vídeos que pretende reproduzir de antemão. Desta forma, você não vai depender do recurso de reprodução automática e apenas passará pela lista de reprodução.