O tráfego RDP é autenticado e criptografado usando TLS, a partir do NT 6 (Vista / Server 2008); O NT 5.2 (Server 2003 / XP x64) usaria criptografia oportunisticamente, mas poderia ser rebaixado via ataques man-in-the-middle. Assim, a transferência dos dados que você imprimirá para o servidor RDP será protegida (a menos que você esteja usando um servidor RDP realmente antigo).
Se os dados entre o servidor RDP e a impressora são seguros depende de como o servidor RDP e a impressora estão conectados e qual protocolo eles usam para se comunicar. No entanto, você enfrentaria essa questão se estivesse usando o RDP ou não, então acho que a pergunta foi respondida.