Would installing windows 8 as the operation system for that new PC damage the datas on the old drives comming from a PC that ran windows 7?
Não, desde que você não os formate ou re-particione, por que instalar o Windows terá algum efeito nessas unidades? A resposta é que não.
Se você estiver preocupado, não conecte as unidades antes de instalar o Windows e fazer com que ele seja inicializado corretamente.